Hola,
pues puedes por ejemplo lavarlos con agua tibia y/o frotar con mucho cuidado con los dedos para intentar eliminar la mayor cantidad de hongos que puedas, aunque lo normal es que siempre queden algunas esporas o micelio...con lo cual tendrás que tenerlos unos días vigilados para que no vuelvan a desarrollarse.
En cuanto a si los huevos saldrán adelante o no, pues normalmente depende de si el hongo ha llegado al interior del huevo o no. Si ha llegado a penetrar la "cáscara" (normalmente lo hacen por el borde del opérculo), lo normal es que ya no haya nada que hacer.
¿De qué especie son los huevos? ¿tienes fotos para ver en qué estado están?
Saludos